Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCARF2Q96GP6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms