Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP36Q96G28 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP36Q96G28 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms