Protein–RNA interactions for Protein: Q96G25

MED8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED8Q96G25 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MED8Q96G25 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED8Q96G25 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms