Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEIL1Q96FI4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms