Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms