Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms