Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms