Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms