Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCC1Q96CN9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GCC1Q96CN9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms