Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDF1Q96CC6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDF1Q96CC6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms