Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms