Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF428Q96B54 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms