Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CCDC74AQ96AQ1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CCDC74AQ96AQ1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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