Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLUAP1Q96AJ1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms