Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRRC59Q96AG4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LRRC59Q96AG4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LRRC59Q96AG4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LRRC59Q96AG4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LRRC59Q96AG4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LRRC59Q96AG4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LRRC59Q96AG4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC59Q96AG4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRC59Q96AG4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms