Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MKL1Q969V6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms