Protein–RNA interactions for Protein: Q92949

FOXJ1, Forkhead box protein J1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXJ1Q92949 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXJ1Q92949 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXJ1Q92949 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXJ1Q92949 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms