Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PROX1Q92786 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PROX1Q92786 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms