Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL2Q92772 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL2Q92772 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms