Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF516Q92618 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF516Q92618 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms