Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms