Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RGP1Q92546 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGP1Q92546 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGP1Q92546 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGP1Q92546 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGP1Q92546 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGP1Q92546 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms