Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC37.57■■■■□ 3.61
TRIM41Q8WV44 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms