Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPBAR1Q8TDU6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms