Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms