Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms