Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC110Q8TBZ0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms