Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI51

CTCFL, Transcriptional repressor CTCFL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFLQ8NI51 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CTCFLQ8NI51 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTCFLQ8NI51 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
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