Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG48

LINS1, Protein Lines homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1Q8NG48 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINS1Q8NG48 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINS1Q8NG48 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINS1Q8NG48 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LINS1Q8NG48 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LINS1Q8NG48 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINS1Q8NG48 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINS1Q8NG48 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINS1Q8NG48 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINS1Q8NG48 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINS1Q8NG48 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINS1Q8NG48 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINS1Q8NG48 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINS1Q8NG48 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINS1Q8NG48 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINS1Q8NG48 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINS1Q8NG48 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINS1Q8NG48 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINS1Q8NG48 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINS1Q8NG48 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINS1Q8NG48 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LINS1Q8NG48 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINS1Q8NG48 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINS1Q8NG48 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINS1Q8NG48 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINS1Q8NG48 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINS1Q8NG48 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINS1Q8NG48 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINS1Q8NG48 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINS1Q8NG48 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINS1Q8NG48 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINS1Q8NG48 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINS1Q8NG48 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINS1Q8NG48 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINS1Q8NG48 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINS1Q8NG48 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINS1Q8NG48 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINS1Q8NG48 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINS1Q8NG48 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINS1Q8NG48 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LINS1Q8NG48 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LINS1Q8NG48 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms