Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms