Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOF1Q8ND07 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms