Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.4 ms