Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87AQ8NBN3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM87AQ8NBN3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms