Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DNAAF3Q8N9W5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms