Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5J2

MINDY1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY1Q8N5J2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MINDY1Q8N5J2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms