Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC65Q8IXS2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms