Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPBP1Q86WP2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GPBP1Q86WP2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms