Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTU1Q7Z7A3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms