Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R42Q7Z4L9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP1R42Q7Z4L9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms