Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z407

CSMD3, CUB and sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSMD3Q7Z407 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSMD3Q7Z407 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms