Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC46A3Q7Z3Q1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC46A3Q7Z3Q1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms