Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
STRCQ7RTU9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
STRCQ7RTU9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms