Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PTF1AQ7RTS3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTF1AQ7RTS3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms