Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP34Q70CQ2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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