Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms