Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms