Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC129Q6ZRS4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms