Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRC1

C4orf50, Uncharacterized protein C4orf50, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf50Q6ZRC1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf50Q6ZRC1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
C4orf50Q6ZRC1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf50Q6ZRC1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf50Q6ZRC1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf50Q6ZRC1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf50Q6ZRC1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf50Q6ZRC1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf50Q6ZRC1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf50Q6ZRC1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf50Q6ZRC1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf50Q6ZRC1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms