Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNG9

KRBA2, KRAB-A domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA2Q6ZNG9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRBA2Q6ZNG9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRBA2Q6ZNG9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms