Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms